但硅藻泥的發展，也面臨著兩大問題：一是行業門檻較低，硅藻泥的質量良莠不齊;二是行業缺乏嚴格有效的監管、準則、制度。在看到了硅藻泥巨大的發展空間后，很多小型硅藻泥廠家肆意夸大品質及功能，產品質量堪憂，嚴重誤導了消費選擇，破壞了市場環境。而規則與監管的缺失，會導致市場產品、價格、服務紊亂。
為了促進硅藻泥行業的健康發展，生態環境協會引入了國家質量認證，對硅藻泥廠家的行為進行規范。對硅藻泥加盟商來說，應該選好品牌，通過線上及實地考察的方式對硅藻泥廠家進行全面了解。
有的品牌一直將自己有硅藻土礦為噱頭來宣傳，其實，硅藻泥品牌的好壞并非與有無硅藻土礦有必然的關系。硅藻土是不可再生的礦產資源，當硅藻土礦挖掘到一定程度時，硅藻土的品質就會有所改變，而有些硅藻泥品牌沒有自身的硅藻土礦，但是會擇優選擇硅藻土礦合作。所以，有無硅藻土礦，并非選擇品牌的指標。
甲醛的凈化率、抗霉菌性能等各項檢測報告、ISO9001國際質量管理體系認證等相關資質證書的含金量很高，所以，考察硅藻泥代理廠家，這些是必看的指標報告。
其他已有代理商的口碑對于考察商來說至關重要，代理商對該品牌的評價比較客觀，可以作為考察商選擇品牌的一個重要依據。